More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3680 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
744 aa  1499    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  39.17 
 
 
693 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
700 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
745 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
757 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
686 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
713 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
708 aa  364  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
754 aa  360  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
752 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
676 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
739 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0036  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
759 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.488776  normal  0.166978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
636 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  35.61 
 
 
760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
744 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
649 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1363 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
916 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
1069 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
1369 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
833 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1128 aa  316  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  38.83 
 
 
650 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1398 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.27 
 
 
1135 aa  309  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.33 
 
 
852 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1267 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1622 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
816 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
929 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1260 aa  301  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1768 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
812 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1611 aa  297  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1245 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
927 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1064 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1548 aa  294  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
946 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
866 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
1040 aa  290  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1767 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1767 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.97 
 
 
1765 aa  289  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1313 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1582 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
1765 aa  287  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.57 
 
 
1763 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
887 aa  287  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1397 aa  286  9e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.7 
 
 
1322 aa  286  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
876 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
914 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
1284 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.56 
 
 
1014 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1767 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1193 aa  283  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.94 
 
 
2213 aa  283  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1326 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1782 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.26 
 
 
1442 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1255 aa  280  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.4 
 
 
923 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
835 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1786 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1245 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
1266 aa  278  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
1771 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1033 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1659 aa  278  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
758 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1118 aa  278  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
921 aa  277  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1784 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.9 
 
 
891 aa  276  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
1560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1258 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.56 
 
 
1331 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
682 aa  274  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  35.58 
 
 
847 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1792 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1126 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1240 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
705 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  37.45 
 
 
850 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1131 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
770 aa  273  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.57 
 
 
1407 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1305 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  38.4 
 
 
531 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.82 
 
 
2035 aa  273  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1202 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  29.9 
 
 
1683 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
784 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.4 
 
 
1499 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  34.5 
 
 
727 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
801 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  34.66 
 
 
1297 aa  271  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>