More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3671 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  100 
 
 		 322 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.87 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  54.6 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  54.6 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.11 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0060  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.16 
 
 		 316 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.51 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.44 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  45.82 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.03 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  44.44 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.65 
 
 		 325 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0143  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.34 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.25 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.7 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.82 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.45 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.65 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.59 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.12 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.67 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.67 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.97 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0618  signal peptide peptidase A  40.93 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.87 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0401  signal peptide peptidase SppA  38.52 
 
 		 288 aa  203  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.33 
 
 		 383 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.23 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0409  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.88 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.927346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  38.22 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.88 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.24 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  36.07 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.8 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.08 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.1 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.1 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.69 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  39.41 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.9 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.11 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.29 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.29 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.7 
 
 		 366 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.58 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.03 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.21 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.88 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.09 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.38 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.12 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.74 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.03 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.12 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.13 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  38.05 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  42.35 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.4 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  35.12 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.62 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.95 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  35.84 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.16 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  37.26 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.24 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  30.13 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0322  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.84 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491128  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.17 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  36.59 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.83 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  38.92 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.3 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.51 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  38.31 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.04 
 
 		 611 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.15 
 
 		 626 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  34.39 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.83 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  36.76 
 
 		 270 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.54 
 
 		 604 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.96 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.98 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.87 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.02 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.39 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.33 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  32.08 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.54 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  35 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.59 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.68 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  32.19 
 
 		 513 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>