More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3635 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
515 aa  1050    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 
529 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
529 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  32.14 
 
 
522 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 
526 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
518 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
539 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 
520 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
529 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.13 
 
 
538 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  30.08 
 
 
516 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 
496 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.05 
 
 
526 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 
502 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 
538 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 
532 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
511 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
540 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
525 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
519 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.19 
 
 
535 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
535 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
527 aa  203  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  30.32 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 
545 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.15 
 
 
516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
540 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
527 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
523 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
527 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
513 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.29 
 
 
545 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 
527 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 
533 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.14 
 
 
510 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 
537 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.22 
 
 
535 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  34.63 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.82 
 
 
534 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 
495 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
514 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
513 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
510 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
516 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  32.57 
 
 
499 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
492 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
534 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.95 
 
 
537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
512 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
512 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
512 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 
505 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
522 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
493 aa  160  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
517 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
528 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
536 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
537 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
521 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
510 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
519 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
538 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.81 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
561 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
534 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.78 
 
 
535 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
536 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.67 
 
 
502 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.79 
 
 
520 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  25.95 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 
503 aa  148  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.42 
 
 
521 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
534 aa  147  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 
554 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
520 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
520 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.42 
 
 
528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
489 aa  146  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.19 
 
 
521 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.19 
 
 
521 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>