More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3607 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  71.92 
 
 		 212 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  68.37 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  71.92 
 
 		 217 aa  284  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  67.79 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  67.31 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  66.98 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  66.83 
 
 		 214 aa  266  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  59.33 
 
 		 215 aa  237  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  56.4 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  55.92 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  56.4 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  56.4 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  51.64 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  52.61 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  52.61 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  55.12 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  54.55 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  56.16 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  56.52 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  56.52 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  54.27 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  53.33 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  55.56 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  56.59 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  51.66 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  51.94 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  50.75 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  51.96 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  50.79 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  51.49 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  53.43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  56.32 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  56.25 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  45.59 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.32 
 
 		 674 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  46.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.43 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.23 
 
 		 667 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.31 
 
 		 668 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.12 
 
 		 675 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  43.28 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  46.31 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.33 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  48.54 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.92 
 
 		 673 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.92 
 
 		 673 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.22 
 
 		 705 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  39.13 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  40.58 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  42.08 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  35.05 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  44.02 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  43.24 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  35.75 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1495  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0926  cytidylate kinase  46.31 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.28 
 
 		 653 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.25 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.47 
 
 		 699 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  44.66 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>