More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3578 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  993    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  51.5 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  51.11 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  50.91 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  50.81 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  50.5 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  50.2 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  50.3 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  48.38 
 
 		 505 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  47.17 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  47.56 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  44.65 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  50.41 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  49.59 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  48.03 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  48.18 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  50.2 
 
 		 529 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  48.57 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  49.8 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  45.55 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  46.91 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  43.89 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  43.43 
 
 		 523 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  43.04 
 
 		 562 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.11 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  40.76 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  38.22 
 
 		 365 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 		 360 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  35.12 
 
 		 332 aa  160  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 		 328 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  38.58 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 327 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 342 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 		 332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  56.92 
 
 		 150 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  34.14 
 
 		 341 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  30.46 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.79 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  34.52 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  34.28 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  30.96 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  33.02 
 
 		 352 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 		 357 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  32.69 
 
 		 330 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  26.01 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  30.3 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  53.38 
 
 		 169 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 		 333 aa  114  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  56.88 
 
 		 164 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  55.04 
 
 		 161 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  30.57 
 
 		 362 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  44.97 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  47.62 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 		 372 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  51.11 
 
 		 161 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  44.52 
 
 		 157 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 346 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  47.76 
 
 		 188 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  46.27 
 
 		 156 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  45.93 
 
 		 160 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  26.97 
 
 		 325 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  59.41 
 
 		 149 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  32.46 
 
 		 363 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  45.93 
 
 		 160 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  45.52 
 
 		 153 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  31.39 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 		 333 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  30.21 
 
 		 308 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  33.97 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  52.38 
 
 		 157 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>