More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3564 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  40.88 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 315 aa  101  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.17 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  30.08 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.77 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  33.65 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>