254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3492 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.48 
 
 		 184 aa  327  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.48 
 
 		 184 aa  325  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  90.91 
 
 		 184 aa  323  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.52 
 
 		 185 aa  308  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.55 
 
 		 175 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  85.8 
 
 		 186 aa  298  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.61 
 
 		 190 aa  293  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.68 
 
 		 184 aa  293  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.03 
 
 		 186 aa  291  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 184 aa  291  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  85.47 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.71 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.27 
 
 		 206 aa  284  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.71 
 
 		 186 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.71 
 
 		 186 aa  278  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  76 
 
 		 176 aa  277  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.57 
 
 		 176 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.03 
 
 		 193 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.03 
 
 		 187 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  80 
 
 		 182 aa  275  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.03 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.78 
 
 		 189 aa  271  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.63 
 
 		 187 aa  265  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.58 
 
 		 187 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.71 
 
 		 191 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.63 
 
 		 182 aa  263  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.63 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.17 
 
 		 183 aa  262  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.37 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 		 182 aa  257  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.16 
 
 		 184 aa  255  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.89 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.41 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.13 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.79 
 
 		 188 aa  248  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.84 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.75 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.69 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.96 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 184 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.71 
 
 		 185 aa  235  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.98 
 
 		 188 aa  235  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.47 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 204 aa  231  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.64 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 		 184 aa  230  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 188 aa  229  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 172 aa  227  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 		 187 aa  224  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 181 aa  223  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 176 aa  223  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 178 aa  221  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  60.8 
 
 		 180 aa  220  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 175 aa  220  8e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 176 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.2 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 174 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.66 
 
 		 196 aa  217  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.07 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.85 
 
 		 176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  63.95 
 
 		 176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>