More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3482 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
242 aa  493  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  67.38 
 
 
234 aa  318  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  67.38 
 
 
234 aa  318  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  66.67 
 
 
231 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  63.32 
 
 
236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  63.75 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  63.4 
 
 
245 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  62.55 
 
 
240 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.98 
 
 
234 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.9 
 
 
238 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.33 
 
 
238 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.07 
 
 
236 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.07 
 
 
241 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.94 
 
 
236 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.85 
 
 
236 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.08 
 
 
232 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.54 
 
 
239 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  54.31 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.42 
 
 
232 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.3 
 
 
239 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.35 
 
 
231 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.36 
 
 
231 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.71 
 
 
231 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.1 
 
 
240 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.16 
 
 
230 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 
235 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.38 
 
 
243 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.17 
 
 
228 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.78 
 
 
240 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.51 
 
 
231 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.02 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.29 
 
 
231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  52.17 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.17 
 
 
229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.29 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.81 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.22 
 
 
225 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.67 
 
 
236 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.26 
 
 
239 aa  205  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.78 
 
 
230 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.9 
 
 
238 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.28 
 
 
235 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.35 
 
 
237 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.48 
 
 
243 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.61 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.45 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  45.45 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.22 
 
 
226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  47.9 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.05 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.11 
 
 
239 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  46.4 
 
 
252 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  46.72 
 
 
244 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  47.77 
 
 
241 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  46.72 
 
 
244 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  47.81 
 
 
238 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.5 
 
 
238 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.67 
 
 
243 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  46.19 
 
 
244 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  43.86 
 
 
233 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  47.23 
 
 
249 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  47.5 
 
 
246 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.89 
 
 
237 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.28 
 
 
243 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.64 
 
 
237 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.13 
 
 
234 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
240 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
240 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  43.86 
 
 
233 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.64 
 
 
237 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.26 
 
 
242 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.83 
 
 
242 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.8 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.84 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  46.28 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.04 
 
 
236 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  46.06 
 
 
245 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.93 
 
 
239 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.99 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  45.9 
 
 
244 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
246 aa  188  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
243 aa  188  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
243 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  46.03 
 
 
243 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.03 
 
 
246 aa  187  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.75 
 
 
253 aa  187  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.61 
 
 
237 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.38 
 
 
248 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.83 
 
 
242 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.83 
 
 
242 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>