166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3475 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  64.04 
 
 
178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  64.37 
 
 
178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  63.48 
 
 
178 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  59.41 
 
 
178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  60.59 
 
 
178 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  65.71 
 
 
144 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  63.4 
 
 
180 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  62.94 
 
 
146 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  62.94 
 
 
146 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  62.24 
 
 
146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  61.87 
 
 
140 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  62.59 
 
 
139 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  61.43 
 
 
140 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  62.86 
 
 
141 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  62.86 
 
 
141 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  58.45 
 
 
146 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  58.16 
 
 
146 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  57.45 
 
 
146 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  57.75 
 
 
143 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  53.22 
 
 
179 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  60 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  53.96 
 
 
143 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  53.52 
 
 
148 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  55.8 
 
 
141 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  52.05 
 
 
149 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  51.8 
 
 
148 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  49.3 
 
 
141 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  49.3 
 
 
141 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  49.3 
 
 
141 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  49.3 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  45.45 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  47.14 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  47.86 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  49.64 
 
 
149 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  47.14 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  47.55 
 
 
139 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  44.44 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  44.37 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  48.2 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  43.66 
 
 
142 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  43.26 
 
 
149 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  47.48 
 
 
144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  47.86 
 
 
148 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  47.18 
 
 
142 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  47.79 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  43.45 
 
 
140 aa  111  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  49.31 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  44.6 
 
 
150 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  48.61 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  44.53 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  43.14 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  42.75 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  41.38 
 
 
142 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  47.48 
 
 
142 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  43.07 
 
 
144 aa  105  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  43.45 
 
 
154 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  39.71 
 
 
136 aa  104  7e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  45.07 
 
 
142 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  39.42 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  47.18 
 
 
140 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  45.77 
 
 
140 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  37.24 
 
 
150 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  37.24 
 
 
150 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  37.68 
 
 
168 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  40.43 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  37.24 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  42.14 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  40.71 
 
 
138 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  41.13 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  36.36 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  42.14 
 
 
141 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  41.13 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  46.43 
 
 
144 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  94.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  41.84 
 
 
142 aa  94.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  39.01 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  33.57 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  40.56 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  91.3  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  40.15 
 
 
138 aa  90.9  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  40.14 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  40.14 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>