More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3351 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  73.42 
 
 
242 aa  328  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  72.85 
 
 
242 aa  324  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  72.85 
 
 
242 aa  324  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  69.23 
 
 
239 aa  305  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  66.67 
 
 
227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  66.67 
 
 
235 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  66.67 
 
 
235 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  65.77 
 
 
260 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  65.77 
 
 
230 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  65.16 
 
 
235 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  64.6 
 
 
231 aa  292  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  65.62 
 
 
246 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  65.47 
 
 
246 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  65.18 
 
 
241 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  65.32 
 
 
235 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  65.3 
 
 
228 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  62.83 
 
 
231 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  65.75 
 
 
247 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  65.44 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  70 
 
 
211 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.603113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  64.52 
 
 
240 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0830  ABC transporter related  65.02 
 
 
237 aa  279  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229113  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  55.9 
 
 
230 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0699  ABC transporter related  59.63 
 
 
233 aa  254  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.664628  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0125  ABC transporter related  59.73 
 
 
228 aa  254  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207988  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  57.92 
 
 
230 aa  254  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  56.36 
 
 
234 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  58.72 
 
 
237 aa  247  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  55.86 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  54.88 
 
 
217 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  54.13 
 
 
249 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  58.05 
 
 
258 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  54.26 
 
 
234 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  58.5 
 
 
202 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3287  ABC transporter related  57.92 
 
 
229 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2678  ABC transporter  59.39 
 
 
234 aa  234  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00869869  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0549  ABC transporter related  68.82 
 
 
174 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3602  ABC efflux transporter, ATPase subunit  57.47 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  53.04 
 
 
233 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  51.38 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 
227 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3956  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  55.2 
 
 
229 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
227 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  53.12 
 
 
233 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  52.68 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
238 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  52.68 
 
 
237 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 
224 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  53.4 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  52.23 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 
226 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  49.12 
 
 
236 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  50.92 
 
 
224 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  53.3 
 
 
219 aa  218  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  53.54 
 
 
247 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  48.68 
 
 
228 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  51.9 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  47.69 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  50.92 
 
 
224 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  51.9 
 
 
249 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 
253 aa  215  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  52.4 
 
 
249 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.86 
 
 
228 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  52.4 
 
 
249 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 
238 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
238 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  48.66 
 
 
228 aa  214  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
225 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  47.73 
 
 
238 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  50.69 
 
 
250 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  49.32 
 
 
246 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  48.68 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  48.39 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.38 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  51.43 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.38 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  50 
 
 
227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.38 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.38 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  51.98 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  51.69 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  50.23 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  51.69 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  51.69 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  51.77 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  49.33 
 
 
228 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50 
 
 
228 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  53.08 
 
 
224 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  54 
 
 
239 aa  209  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  53.08 
 
 
224 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
226 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  53.06 
 
 
249 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>