223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3349 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  78.5 
 
 		 196 aa  291  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  77 
 
 		 196 aa  291  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  78.5 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  69.07 
 
 		 195 aa  278  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  69.35 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  68.09 
 
 		 197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  67.71 
 
 		 195 aa  250  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  63.64 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  61.93 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  58.7 
 
 		 188 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  59.66 
 
 		 178 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  59.09 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  60.23 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  58.19 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  56.25 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  56.25 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  55.62 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  62.71 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  56.18 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  49.44 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  51.96 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  50 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  49.71 
 
 		 183 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  48.88 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  42.86 
 
 		 184 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  44.63 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  42.29 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  37.91 
 
 		 184 aa  121  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 179 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  38.79 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  40.91 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  39.33 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.09 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.72 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  43.31 
 
 		 177 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.77 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  36.87 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  37.22 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  38.12 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  35.54 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  33.59 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  38.35 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.17 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.58 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.47 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  34.35 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  32.35 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  33.08 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  33.08 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  33.08 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  35.09 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  38.06 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  32.28 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  29.74 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  31.5 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  34.73 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.91 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  32.28 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.33 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.82 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  32.52 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  31.5 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  26.99 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.36 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.98 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  29.92 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  26.09 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.66 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  26.86 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  32.48 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  32.74 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.15 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  29.56 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  34.86 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  24.56 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>