43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3345 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  367  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  65.16 
 
 		 204 aa  219  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  62.35 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  64.52 
 
 		 167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  56.89 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  50.3 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  52.07 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  54.29 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  46.11 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  40.96 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  43.53 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  40.62 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  38.32 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  37.35 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  36.93 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  37.64 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  37.66 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  37.25 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  33.58 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  35.67 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  36.05 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  35.81 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  34.66 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  37.82 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  36.73 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  34.72 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  32.17 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  26.86 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  25.14 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  27.85 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  24.85 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  24.85 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  24.84 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  57.89 
 
 		 39 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>