97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3317 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 345 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  53.31 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  52.45 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  52.16 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  46.02 
 
 		 347 aa  319  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  41.52 
 
 		 343 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  38.78 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  37.9 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  37.28 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  42.03 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  38.78 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  36.73 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  42.9 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  39.02 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  37.5 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  38.62 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  38.08 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  37.32 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  37.03 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  38.33 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  38.04 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  35.55 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  34.81 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  36.78 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  37.46 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  37.07 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  36.86 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  37.07 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  35.8 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  28.43 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  30.67 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  29.18 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  20.62 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  29.49 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  20.13 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  29.08 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  27.62 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  28.08 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  28.72 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  29.07 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  30 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  29.71 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  29.71 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  23.58 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  29.58 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.76 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.31 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  25.41 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.99 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.42 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  22.13 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  27.34 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  30.23 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  22.03 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  21.57 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.22 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  26.06 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  29.13 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  26.06 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.63 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  28.5 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3481  DNA-directed DNA polymerase  21.4 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000216936  unclonable  0.0000000000757173 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  28.05 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0795  DNA polymerase III, delta subunit  19.93 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  27.64 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  21.07 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2865  DNA polymerase III, delta subunit  20.14 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00085099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  22.63 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  18.89 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.83 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2584  DNA-directed DNA polymerase  22.05 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000509755  normal  0.168307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.41 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.39 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  28.74 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.96 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  25.12 
 
 		 325 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>