More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3300 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.62 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  28.22 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  29.75 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.3 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.05 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  29.2 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  29.39 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  29.34 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  30.67 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  29.61 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  29.79 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  27.88 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.2 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  26.67 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.44 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  28.24 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  29.94 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  26.22 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  27.84 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  27.8 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  30.56 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  25.68 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  26.81 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  31.89 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  31.6 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  29.66 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  29.93 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  29.19 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  27.63 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  29.19 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  27.41 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  25.08 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  29.32 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  27.5 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  30.57 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  29.71 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  31.93 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  31.03 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  27.16 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  31.21 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  29.57 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  28.16 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  29.78 
 
 		 327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  29.3 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  33.22 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  29.66 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6029  hypothetical protein  27.87 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  24.2 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  30.11 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  28.72 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  26.77 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  29.55 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  25.99 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  31.29 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  27.33 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  28.42 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  30.31 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  28.83 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32.31 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  28.88 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  28.41 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  29.24 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  29.58 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  27.84 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  28.96 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  30.74 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  25.99 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  28.96 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  27.8 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  27.31 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  30.8 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  27.24 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  29.68 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  28.76 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  26.63 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  31.06 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  25.16 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  29.56 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  30.32 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  28.77 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  28.77 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  28.43 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  27.24 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>