More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3260 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 545 aa  1036    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  60.33 
 
 		 543 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  56.92 
 
 		 541 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  51.61 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  51.49 
 
 		 542 aa  359  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  42.53 
 
 		 530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  42.2 
 
 		 535 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  42 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  41.79 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  41.31 
 
 		 536 aa  332  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  44.35 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  44.35 
 
 		 536 aa  332  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  44.14 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  43.92 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  44.14 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  43.92 
 
 		 536 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  43.92 
 
 		 536 aa  330  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  43.51 
 
 		 536 aa  329  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  43.71 
 
 		 536 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  42.26 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  42.26 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  42.26 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  42.26 
 
 		 536 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  42.07 
 
 		 536 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  39.25 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  41.14 
 
 		 535 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  41.63 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  38.91 
 
 		 516 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  38.7 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  41.14 
 
 		 535 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  37.81 
 
 		 540 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.72 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  37.42 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  41.67 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  42.34 
 
 		 537 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  43.54 
 
 		 523 aa  264  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  41.31 
 
 		 521 aa  256  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  41.87 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  42.07 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  53.8 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 		 606 aa  113  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.15 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.04 
 
 		 634 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 		 663 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 		 565 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 532 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 		 564 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.26 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 		 597 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 		 269 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.1 
 
 		 226 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 		 227 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.81 
 
 		 289 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.02 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 		 226 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 226 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  31.16 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  30.06 
 
 		 286 aa  67  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  29 
 
 		 272 aa  67  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4712  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  31.72 
 
 		 291 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000236451  normal  0.214204 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  30.77 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0653  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3072  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1544  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1418  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0500  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1214  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0140518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1411  ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>