281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3224 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  100 
 
 
300 aa  591  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  59.03 
 
 
298 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  60.21 
 
 
298 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  60.21 
 
 
298 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  58.89 
 
 
291 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  58.48 
 
 
291 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  56.07 
 
 
293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  57.09 
 
 
292 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  36.55 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  35.4 
 
 
289 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  37.37 
 
 
290 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  38.95 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  37.88 
 
 
282 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  34.62 
 
 
283 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  34.75 
 
 
283 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  35.11 
 
 
283 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  37.1 
 
 
293 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  31.93 
 
 
286 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  32.17 
 
 
286 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  32.52 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  37.15 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 
286 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  32.71 
 
 
293 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  31.06 
 
 
286 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  33.1 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  34.48 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  33.46 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  33.46 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  33.08 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  33.46 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  33.46 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  33.46 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  33.7 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  32.69 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  32.69 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  30.69 
 
 
289 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  30.82 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  37.45 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  32.04 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  30.42 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  31.64 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  32.28 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  29.72 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  32.08 
 
 
291 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  38.1 
 
 
291 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  32.04 
 
 
290 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  32.31 
 
 
283 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  32.04 
 
 
290 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  36.64 
 
 
283 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 
288 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  32.96 
 
 
283 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  35.64 
 
 
291 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  30.42 
 
 
287 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  30.42 
 
 
286 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  30.42 
 
 
287 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  31.48 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  34.91 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  34.44 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  38.89 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  30.32 
 
 
286 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  31.07 
 
 
287 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  37.72 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  32.37 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  32.82 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  32.82 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  34.38 
 
 
313 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  32.82 
 
 
288 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  32.82 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  32.82 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  32.05 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  31.29 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  33.73 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  33.46 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  32.29 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  33.71 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  34.31 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  32.08 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  34.91 
 
 
283 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  33.7 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  28.67 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  33.7 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  33.7 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>