More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3219 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.52 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.52 
 
 
135 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  60 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.78 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  60.61 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.85 
 
 
135 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.26 
 
 
134 aa  156  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.31 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.31 
 
 
133 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.54 
 
 
133 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
139 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
134 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.85 
 
 
138 aa  100  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.55 
 
 
135 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.51 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  47.32 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.69 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  43.75 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.82 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.71 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.45 
 
 
135 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.52 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.81 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.86 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.49 
 
 
133 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.49 
 
 
133 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.59 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.48 
 
 
133 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.72 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.52 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.98 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.24 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.28 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.93 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.48 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.38 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.17 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.23 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.05 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.05 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.64 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.34 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.72 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  37.27 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.48 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.41 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.1 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.91 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.91 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.46 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.91 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.04 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.58 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.48 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.65 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  37.17 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.63 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.63 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.63 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.78 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.59 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.17 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.29 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.77 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.25 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.56 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.27 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4874  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.89 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.03 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.91 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.04 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.26 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5729  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.26 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337873  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.29 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.23 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.26 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.26 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>