More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3173 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 149 aa  300  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  76.82 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  76.82 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  78.67 
 
 		 150 aa  231  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  78.74 
 
 		 152 aa  210  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  73.83 
 
 		 149 aa  209  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  69.29 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  69.29 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.54 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.67 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.42 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  56.64 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  64.57 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.27 
 
 		 151 aa  157  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  53.06 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  54.03 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  61.16 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.8 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  51.02 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  55 
 
 		 173 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.16 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  53.66 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.85 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.47 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.18 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.31 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.05 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.6 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.03 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.8 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  52.8 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  44.37 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  47.33 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  45.74 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.58 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  50 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  43.57 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.86 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  43.57 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.06 
 
 		 150 aa  116  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.6 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  45.77 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  46.48 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  43.66 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.82 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  39.69 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  45.45 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  47.37 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.06 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  41.43 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  41.43 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.43 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  43.7 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  41.91 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  41.91 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  43.41 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  44.17 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.26 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  45.83 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  43.41 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  42.64 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  42.42 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  40.83 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  42.64 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.14 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  45.59 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.42 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  41.73 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  40 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.31 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  41.98 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  42.97 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  42.97 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  39.22 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  41.8 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  37.93 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  41.67 
 
 		 177 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.24 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  43.8 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  43.8 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  39.69 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.83 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  35.62 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  39.37 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  38.73 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.29 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  39.13 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>