More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3171 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  71.82 
 
 
443 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  71.36 
 
 
443 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  71.36 
 
 
443 aa  662    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  71.82 
 
 
436 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  100 
 
 
439 aa  890    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  70.02 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  70.26 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  67.81 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  63.62 
 
 
450 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  62.7 
 
 
450 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  62.21 
 
 
450 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  62.21 
 
 
450 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  64.25 
 
 
449 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  63.59 
 
 
444 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  61.63 
 
 
446 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  63.83 
 
 
449 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  63.4 
 
 
462 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  58.51 
 
 
443 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  57.14 
 
 
442 aa  499  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  54.22 
 
 
448 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  54.37 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  53.63 
 
 
442 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  53.24 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  51.52 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  51.08 
 
 
446 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  51.08 
 
 
446 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  48.86 
 
 
445 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  51.25 
 
 
446 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  50.33 
 
 
445 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  49.21 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  48.78 
 
 
453 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  49.88 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  49.88 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  49.88 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  49.64 
 
 
439 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  48.2 
 
 
461 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  46.88 
 
 
469 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  48.06 
 
 
462 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  48.05 
 
 
454 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  44.01 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  44.39 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  40.57 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  35.58 
 
 
420 aa  281  1e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  33.64 
 
 
428 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.81 
 
 
415 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  35.1 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.35 
 
 
426 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  35.31 
 
 
435 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.54 
 
 
438 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.51 
 
 
439 aa  236  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.16 
 
 
421 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35.14 
 
 
441 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.33 
 
 
425 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.35 
 
 
442 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.56 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.08 
 
 
422 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.08 
 
 
422 aa  226  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  31.41 
 
 
424 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.48 
 
 
439 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.27 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.92 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  34.34 
 
 
439 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.48 
 
 
443 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.03 
 
 
432 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.67 
 
 
421 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.54 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  35.19 
 
 
408 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  33.49 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  34.53 
 
 
436 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.85 
 
 
435 aa  216  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.88 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.97 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  36.01 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.86 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.74 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.5 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.04 
 
 
457 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.16 
 
 
427 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.1 
 
 
428 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.41 
 
 
433 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.41 
 
 
433 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34 
 
 
450 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.65 
 
 
407 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.28 
 
 
429 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.53 
 
 
407 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.49 
 
 
430 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.92 
 
 
432 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.11 
 
 
435 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  33.26 
 
 
433 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.67 
 
 
446 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.49 
 
 
423 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  34.63 
 
 
432 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  30.19 
 
 
445 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  34.63 
 
 
432 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.84 
 
 
432 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  32.49 
 
 
423 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  33.72 
 
 
432 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.49 
 
 
434 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.25 
 
 
437 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  30.82 
 
 
463 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>