63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3164 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  35.32 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  34.1 
 
 		 275 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  33.6 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  32.21 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  33.6 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  27.15 
 
 		 284 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  29.91 
 
 		 282 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3194  surface antigen msp4 family protein  31.25 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  26.8 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  27.74 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  31.37 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  30.08 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3488  surface antigen msp4 family protein  30.2 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601227  normal  0.0875611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  31.63 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  30.21 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  28.76 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  28.27 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  29.3 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.17 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  32.71 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  32.71 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  26.64 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  30.04 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  32.3 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  29.91 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  29.73 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  27.2 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  26.12 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  26.13 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  26.77 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  30.8 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  29.09 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  27.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  36.44 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  28.66 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  26.19 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 373 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  28.81 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  24.23 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  28.47 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  24.74 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  26.42 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  27.04 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 364 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.76 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.76 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.41 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  26.28 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.41 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  26.28 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  31.86 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.46 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  31.58 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  27.04 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.73 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.53 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  24.12 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.93 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  30.88 
 
 		 240 aa  42  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  35.71 
 
 		 240 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>