21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3086 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  32.45 
 
 
339 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  32.26 
 
 
339 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  30.12 
 
 
339 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  32.04 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  29.63 
 
 
338 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  29.91 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  28.21 
 
 
335 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  28.25 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  24.85 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  30.84 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  28.97 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  28.97 
 
 
366 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  29.82 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  27.06 
 
 
368 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  24.86 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  29.79 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  24.3 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  23.17 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  23.35 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>