More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3038 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  68.27 
 
 
460 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  67.83 
 
 
463 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  81.29 
 
 
466 aa  790    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  69.13 
 
 
471 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  79.61 
 
 
467 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  80.91 
 
 
467 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  79.83 
 
 
466 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  69.25 
 
 
471 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  73.22 
 
 
466 aa  717    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  80.86 
 
 
466 aa  790    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  68.91 
 
 
463 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  67.18 
 
 
459 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  69.25 
 
 
471 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  100 
 
 
473 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  81.29 
 
 
493 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  67.4 
 
 
463 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  67.61 
 
 
463 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  69.21 
 
 
469 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  80.48 
 
 
467 aa  760    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  68.9 
 
 
463 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  67.39 
 
 
476 aa  633  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  68.87 
 
 
466 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  66.09 
 
 
488 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  67.25 
 
 
476 aa  618  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  66.09 
 
 
465 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
463 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  68.05 
 
 
462 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  65.87 
 
 
465 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  66.74 
 
 
462 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  65.36 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  66.09 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  65.62 
 
 
478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  64.54 
 
 
455 aa  601  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  67.77 
 
 
462 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  62.83 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2371  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.219426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  61.4 
 
 
469 aa  568  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  57.89 
 
 
471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  56.65 
 
 
470 aa  558  1e-158  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  59.73 
 
 
458 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  55.26 
 
 
458 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  53.88 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  54.46 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  54.35 
 
 
468 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  54.1 
 
 
458 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  54.53 
 
 
469 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  53.66 
 
 
458 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 
460 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 
467 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  59.96 
 
 
468 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  54.37 
 
 
460 aa  495  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  53.26 
 
 
461 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  54.8 
 
 
465 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 
469 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  54.49 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  53.45 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  53.81 
 
 
467 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 
467 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 
464 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  52.94 
 
 
475 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  53.9 
 
 
463 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  52.81 
 
 
466 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  52.89 
 
 
464 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
460 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
491 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 
468 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  53.07 
 
 
464 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  53.33 
 
 
464 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  52.85 
 
 
464 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 
462 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  52.06 
 
 
462 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
461 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  53.16 
 
 
499 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  52.88 
 
 
464 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
478 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
493 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
461 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  51.84 
 
 
462 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0866  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
460 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
457 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  52.48 
 
 
464 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
504 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  49.46 
 
 
462 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  49.79 
 
 
488 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  50.77 
 
 
457 aa  476  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  51.32 
 
 
461 aa  475  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
486 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  52.65 
 
 
476 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  53.81 
 
 
468 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  53.71 
 
 
468 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
461 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  50.54 
 
 
486 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  52.02 
 
 
465 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  52.24 
 
 
462 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
459 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
459 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
485 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>