79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3018 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
468 aa  920    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  51.18 
 
 
490 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  45.63 
 
 
474 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  44 
 
 
467 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  41.32 
 
 
474 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  41.54 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  39.14 
 
 
459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  34.79 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  34.33 
 
 
458 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 
456 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 
456 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  35.33 
 
 
453 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  35.55 
 
 
458 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  32.75 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  33.07 
 
 
458 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  32.27 
 
 
458 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  33.41 
 
 
446 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 
442 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  35.58 
 
 
445 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
453 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 
539 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
461 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22.4 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
456 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  31.12 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  24.24 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  21.96 
 
 
489 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 
441 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  23.67 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 
494 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
514 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 
480 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  28.66 
 
 
495 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
492 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  28.98 
 
 
496 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  19.32 
 
 
517 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.84 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  29.38 
 
 
490 aa  53.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  21.55 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
495 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
463 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
582 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2278  polysaccharide biosynthesis protein  32.43 
 
 
516 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
490 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  20.85 
 
 
435 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  31.78 
 
 
135 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  27.21 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  27.21 
 
 
522 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
436 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  24.14 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  31.36 
 
 
536 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  24.49 
 
 
485 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  31 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  24.24 
 
 
529 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>