More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2947 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
335 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  43.33 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  43.03 
 
 
325 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
325 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
325 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.69 
 
 
325 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
326 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  41.99 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.69 
 
 
328 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 
325 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.96 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.72 
 
 
324 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  40.96 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
326 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 
319 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
333 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.18 
 
 
326 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
324 aa  209  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 
324 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
361 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.76 
 
 
324 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.74 
 
 
325 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.55 
 
 
324 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
324 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
324 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  40.36 
 
 
324 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.95 
 
 
324 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
324 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.25 
 
 
324 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
324 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.66 
 
 
324 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
327 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  40.42 
 
 
320 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.76 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
326 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
326 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  41.44 
 
 
326 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
323 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
331 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
337 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
324 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.24 
 
 
326 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
326 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.58 
 
 
324 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
326 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
324 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  40.54 
 
 
326 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.54 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
340 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 
324 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
319 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.19 
 
 
323 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.8 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  37.54 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.45 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  39.42 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
321 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.29 
 
 
324 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  40.19 
 
 
319 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.58 
 
 
326 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.95 
 
 
325 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  40.71 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
326 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  34.43 
 
 
328 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
324 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  34.73 
 
 
328 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 
322 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  34.43 
 
 
328 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  34.43 
 
 
328 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.13 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  34.13 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.94 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.83 
 
 
328 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.13 
 
 
328 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
331 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>