More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2815 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2815  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
364 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.793224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2882  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  47.21 
 
 
357 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000710816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4436  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  45.09 
 
 
369 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  46.46 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.135169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0459  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  42.35 
 
 
360 aa  312  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4514  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  48.81 
 
 
364 aa  311  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4440  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  47.08 
 
 
369 aa  305  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.270003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2542  TRAP-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  41 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2011  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  44 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0290842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3441  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.9 
 
 
400 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.837811  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3641  twin-arginine translocation pathway signal  44.38 
 
 
361 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.312252  normal  0.742718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3369  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.9 
 
 
372 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3566  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.72 
 
 
400 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.123987  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0085  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  47.57 
 
 
366 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3763  hypothetical protein  41.84 
 
 
378 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.854395  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1560  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  42.05 
 
 
373 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.198541  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0921  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.28 
 
 
400 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0971  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.06 
 
 
371 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000651502  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0933  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.06 
 
 
371 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329289  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4515  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  45.73 
 
 
360 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0531  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  44.51 
 
 
369 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.887659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0937  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.98 
 
 
369 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.592464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3619  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.07 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0946  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.56 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0935  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  39.76 
 
 
370 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1100  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1846  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 
364 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0598  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.98 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0428  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.53 
 
 
387 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0280038  normal  0.0226901 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0394  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.83 
 
 
379 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331945  hitchhiker  0.00125692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3789  periplasmic mannitol-binding protein  41.64 
 
 
368 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0832  Extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 
363 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0598  twin-arginine translocation pathway signal  42.32 
 
 
362 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1416  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.4 
 
 
367 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2243  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.41 
 
 
360 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273001  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0878  twin-arginine translocation pathway signal  41 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1951  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.92 
 
 
371 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1554  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  39.01 
 
 
360 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1686  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.89 
 
 
365 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.846032  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0449  Extracellular solute-binding protein, family 7  40.31 
 
 
360 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145503  normal  0.0293677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0416  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  39.56 
 
 
360 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000442775  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0528  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  42.77 
 
 
360 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3466  putative periplasmic mannitol-binding protein  39.35 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2874  twin-arginine translocation pathway signal  39.82 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1748  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3467  putative periplasmic mannitol-binding protein  39.35 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1273  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  39.66 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2657  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.33 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4830  Extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.18293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2343  hypothetical protein  40.17 
 
 
361 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.264147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1502  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  39.16 
 
 
360 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2644  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.86 
 
 
373 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.841176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0339  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.91 
 
 
357 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3338  hypothetical protein  40.56 
 
 
358 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4720  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  40.19 
 
 
364 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.607383  normal  0.0697574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1558  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.23 
 
 
368 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2835  putative exported solute binding protein  35.71 
 
 
360 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3120  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.6 
 
 
379 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0172761  normal  0.942467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2999  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.6 
 
 
379 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1749  twin-arginine translocation pathway signal  36.01 
 
 
359 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0960995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1750  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 
359 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2873  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 
359 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0129  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2067  twin-arginine translocation pathway signal  38.32 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1224  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.87 
 
 
360 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2049  twin-arginine translocation pathway signal  40.14 
 
 
362 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3750  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.15 
 
 
355 aa  232  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.871351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3477  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.44 
 
 
358 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2164  transporter, periplasmic component  38.63 
 
 
356 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0458836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0097  TRAP-T family sorbitol/mannitol periplasmic binding protein SmoM  37.35 
 
 
365 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4196  family 1 extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 
333 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1733  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.35 
 
 
365 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2188  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.9 
 
 
363 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0149275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1474  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 
362 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1899  twin-arginine translocation pathway signal  39.23 
 
 
361 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126096  normal  0.504906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1563  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  35.45 
 
 
374 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0179378  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2292  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.69 
 
 
357 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3374  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.89 
 
 
368 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.626283  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3676  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.44 
 
 
368 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1404  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 
358 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3392  twin-arginine translocation pathway signal  39.08 
 
 
362 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0957  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.72 
 
 
360 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.861985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2016  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.98 
 
 
359 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0633546  normal  0.0167782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1039  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.72 
 
 
360 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0821806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2244  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.16 
 
 
359 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.342958  normal  0.0290816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4421  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.11 
 
 
368 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3328  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.88 
 
 
363 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0914439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1572  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.05 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0066  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  42.46 
 
 
403 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000558926  hitchhiker  0.00313159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1216  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.91 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1067  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 
377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3284  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  36.45 
 
 
360 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.970201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1719  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.9 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.457663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0883  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.69 
 
 
364 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550638  hitchhiker  0.00000307081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3543  twin-arginine translocation pathway signal  38.16 
 
 
379 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568783  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1354  trap-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  32.28 
 
 
372 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000150608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0345  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
372 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4010  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.75 
 
 
403 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000079745  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3396  twin-arginine translocation pathway signal  37.1 
 
 
397 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485475  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28431  TRAP-T family tripartite transporter, substrate binding protein  35.67 
 
 
374 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.986733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>