23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2794 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  47.25 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  32.2 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  31.77 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  34.33 
 
 		 315 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  33.58 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  34.01 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  32.5 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  32.53 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  35.46 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  33.14 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  33.14 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  36.29 
 
 		 273 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  33.15 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  30.39 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  31.72 
 
 		 328 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  34.25 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  35.09 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  24.61 
 
 		 300 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.71 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>