30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2738 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1028    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  45.09 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  45.01 
 
 		 512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  45.01 
 
 		 502 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  37.2 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  37.79 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  37.26 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  34.51 
 
 		 505 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  32.28 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  30.08 
 
 		 571 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  30.3 
 
 		 597 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  30.02 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  31.09 
 
 		 546 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  30.73 
 
 		 647 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  30.73 
 
 		 646 aa  143  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  28.79 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  27.97 
 
 		 563 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  28.97 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  24.74 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  28.07 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 563 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  27.32 
 
 		 564 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  25.2 
 
 		 590 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  25.85 
 
 		 552 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  26.38 
 
 		 424 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  26.81 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  24.42 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  26.7 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.06 
 
 		 400 aa  87  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  23.27 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>