More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2648 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
524 aa  1069  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
518 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.95 
 
 
532 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.95 
 
 
524 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
510 aa  176  1e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.16 
 
 
512 aa  175  2e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
520 aa  175  2e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
513 aa  175  2e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
505 aa  174  3e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
517 aa  174  3e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
514 aa  173  7e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.64 
 
 
520 aa  173  7e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
512 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
513 aa  173  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.77 
 
 
512 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.77 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.77 
 
 
512 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.77 
 
 
512 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
512 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.77 
 
 
512 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.68 
 
 
535 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
519 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 
521 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
520 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
512 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
520 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
514 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
595 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.01 
 
 
517 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.88 
 
 
520 aa  167  6e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  166  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 
518 aa  166  7e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
532 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 
534 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 
509 aa  166  1e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.04 
 
 
512 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.85 
 
 
512 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.85 
 
 
512 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 
520 aa  166  1e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.85 
 
 
512 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
533 aa  165  2e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.51 
 
 
517 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
520 aa  164  4e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.72 
 
 
524 aa  164  5e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
520 aa  164  5e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
518 aa  164  5e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.94 
 
 
520 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
538 aa  163  8e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.14 
 
 
520 aa  163  8e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.03 
 
 
493 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
513 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
520 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.12 
 
 
527 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
505 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
520 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
520 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
508 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
531 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.06 
 
 
521 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.06 
 
 
521 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
533 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
521 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
516 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.06 
 
 
521 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.37 
 
 
545 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.06 
 
 
521 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
489 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
528 aa  157  5e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.2 
 
 
510 aa  157  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
532 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
512 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.54 
 
 
516 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
519 aa  154  3e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
527 aa  154  3e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 
532 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.68 
 
 
520 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
521 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
509 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 
508 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.77 
 
 
520 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 
522 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
526 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.12 
 
 
510 aa  151  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
533 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.97 
 
 
508 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
528 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
534 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.35 
 
 
509 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
531 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.19 
 
 
525 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
517 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.55 
 
 
518 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
517 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 
495 aa  149  1e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>