More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2643 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
514 aa  1051    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  43.96 
 
 
392 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 
394 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  37.7 
 
 
390 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  35.51 
 
 
391 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  40.85 
 
 
383 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  38.77 
 
 
385 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 
383 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 
390 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 
391 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  37.99 
 
 
386 aa  246  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  32.09 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  31.82 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  31.82 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  31.82 
 
 
383 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  39.37 
 
 
386 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.55 
 
 
383 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  31.55 
 
 
383 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  31.55 
 
 
383 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 
392 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  31.55 
 
 
383 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 
385 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  38.65 
 
 
390 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  37.47 
 
 
381 aa  238  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.55 
 
 
383 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 
386 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.04 
 
 
398 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  38.01 
 
 
384 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
386 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  39.26 
 
 
370 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  37.36 
 
 
386 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
401 aa  229  8e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
383 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
390 aa  229  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  34.11 
 
 
417 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 
386 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  33.52 
 
 
394 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
391 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 
383 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.58 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.5 
 
 
409 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  34.28 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  31.79 
 
 
393 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  31.79 
 
 
393 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 
393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 
379 aa  217  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.24 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  35.22 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 
385 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  32.98 
 
 
385 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
385 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  32.25 
 
 
397 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 
391 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.18 
 
 
389 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  33.78 
 
 
394 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 
396 aa  207  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.73 
 
 
394 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  33.97 
 
 
421 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 
392 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 
386 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  34.16 
 
 
393 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  32.22 
 
 
414 aa  203  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 
384 aa  203  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  34.53 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.27 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  31.7 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  31.12 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  37.31 
 
 
376 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  31.03 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  32.31 
 
 
372 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
384 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  33.96 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.62 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  32.18 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.54 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 
521 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  29.64 
 
 
404 aa  193  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30.38 
 
 
390 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 
399 aa  193  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  35.1 
 
 
375 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.32 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 
393 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 
393 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  28.09 
 
 
397 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 
391 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 
390 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  32.41 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  31.7 
 
 
390 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  33.86 
 
 
386 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  30.75 
 
 
388 aa  183  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  29.29 
 
 
392 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  32.25 
 
 
402 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>