More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2613 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  66.92 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  60.08 
 
 		 293 aa  314  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  58.78 
 
 		 284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  59.07 
 
 		 297 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  59.07 
 
 		 297 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  64.37 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  60.55 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  58.91 
 
 		 280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  61.74 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  60.63 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  58.96 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  63.08 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  60.47 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  58.08 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  58.85 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  58.85 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  59.46 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  58.69 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  64.62 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  57.43 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  54.96 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  54.9 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  64.48 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  57.36 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  57.75 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  57.36 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  56.86 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  53.33 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  58.14 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  57.99 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  32.03 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.17 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  33.18 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.84 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.69 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.7 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 289 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.79 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.67 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.72 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  29.39 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.71 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.2 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.89 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.34 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.49 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.34 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  27.95 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.8 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  31.05 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.98 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.87 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  24.51 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  25.42 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  27.51 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.64 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  26.7 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  29.15 
 
 		 665 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  24.12 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.38 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>