More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2608 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.33 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 
333 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.59 
 
 
449 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.52 
 
 
381 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.38 
 
 
213 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 
521 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
216 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 
1033 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 
517 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
567 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.09 
 
 
493 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.56 
 
 
489 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 
309 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
386 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.89 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.74 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.93 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  34.5 
 
 
366 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.74 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.51 
 
 
389 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  42.07 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
515 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36.61 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.6 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.87 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.1 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  37 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  37 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  43.85 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.75 
 
 
734 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.5 
 
 
366 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  36.87 
 
 
727 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 
343 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 
343 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 
903 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  33.05 
 
 
440 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.83 
 
 
175 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.89 
 
 
412 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
219 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 
441 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.58 
 
 
311 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.98 
 
 
340 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.52 
 
 
189 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  32.34 
 
 
366 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  32.34 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.76 
 
 
576 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.41 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 
448 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.88 
 
 
862 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.91 
 
 
300 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 
225 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.8 
 
 
452 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  38 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 
336 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.18 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.93 
 
 
416 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 
336 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 
483 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30.91 
 
 
706 aa  85.5  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.56 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.89 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.67 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.69 
 
 
745 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 
182 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 
419 aa  82  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  41.38 
 
 
215 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 
145 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 
260 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  42.76 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 
776 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.53 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  34.16 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.38 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 
844 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>