158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2593 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  100 
 
 
442 aa  877    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  37.44 
 
 
434 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  35.7 
 
 
438 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  35.11 
 
 
436 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  35.81 
 
 
437 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  33.17 
 
 
427 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  35.31 
 
 
435 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  34.07 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
461 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
422 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  29.86 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  32.11 
 
 
426 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
411 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  32.32 
 
 
410 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  32.32 
 
 
410 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.46 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.27 
 
 
415 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  30.59 
 
 
415 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  27.72 
 
 
425 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.92 
 
 
451 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.75 
 
 
423 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  26.82 
 
 
419 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.91 
 
 
439 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  28.25 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  35.9 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  43.75 
 
 
189 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  41 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  26.13 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  26.65 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.25 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  24.65 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.13 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.9 
 
 
187 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  41.84 
 
 
208 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  33.94 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  33.94 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  27.29 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  41.49 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  26.68 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.1 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  39.58 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  39.02 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  36.29 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  40.62 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.49 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  28.36 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.82 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.82 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  39.77 
 
 
177 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.68 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  38.53 
 
 
196 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.4 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.66 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  39.8 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  39.77 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  39.18 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.44 
 
 
152 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  38.89 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  27.24 
 
 
501 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  38.53 
 
 
213 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  38.89 
 
 
235 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
451 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.23 
 
 
192 aa  63.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.05 
 
 
433 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  39.64 
 
 
205 aa  63.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
185 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  33.83 
 
 
237 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40.48 
 
 
153 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
185 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  23.9 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
185 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.56 
 
 
177 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  42.71 
 
 
205 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
247 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.49 
 
 
442 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  24.51 
 
 
816 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
184 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  37.61 
 
 
220 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  33.68 
 
 
178 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.52 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.39 
 
 
492 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.9 
 
 
178 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.46 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  37.84 
 
 
196 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  26.09 
 
 
661 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.83 
 
 
177 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
193 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.16 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  28.3 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.26 
 
 
451 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.3 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30.14 
 
 
186 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.35 
 
 
505 aa  53.5  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.18 
 
 
440 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  36.8 
 
 
192 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  38.89 
 
 
190 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>