279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2546 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 422 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  49.75 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  48.31 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  49.04 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  48.54 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  47.29 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3515  allantoate amidohydrolase  50 
 
 		 412 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  47.09 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  47.22 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  45.04 
 
 		 429 aa  288  9e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  44.26 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.62 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  38.29 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  38.63 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  38.92 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.96 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  39.05 
 
 		 424 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.59 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  37.01 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.89 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  37.5 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  40.98 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  40.1 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  38.01 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  36.6 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  38.74 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.2 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.98 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.98 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1507  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.1 
 
 		 469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0692764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  37.04 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.24 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.55 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  39.24 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  39.08 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  40.49 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  38.05 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.49 
 
 		 523 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  35.95 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  39.18 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  37.98 
 
 		 421 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  37.98 
 
 		 425 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.07 
 
 		 415 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  38.11 
 
 		 429 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  36.67 
 
 		 420 aa  225  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.7 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  38.69 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.74 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  38.1 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.63 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  38.29 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  37.3 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  37.7 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  37.8 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  36.03 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.87 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  39.19 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  34.44 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  36.59 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  38.13 
 
 		 421 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  37.62 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  38.85 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  36.99 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  36.98 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.19 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  37.37 
 
 		 416 aa  216  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  37.62 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  37.62 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.92 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.23 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  38.24 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.65 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  37.17 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  37.38 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  37.25 
 
 		 423 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  36.65 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  34.95 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  37.83 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  34.91 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  38.11 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  36.73 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.39 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  36.86 
 
 		 442 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  39.52 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  39.03 
 
 		 429 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  36.66 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  38.3 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  35.7 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>