More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2500 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  100 
 
 		 308 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  55.97 
 
 		 335 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.05 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  30.24 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  27.83 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  30.86 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  28.07 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  29.7 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  27.44 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  23.51 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  23.51 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  23.13 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  23.13 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  23.13 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 214 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  26.16 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  36.36 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  26.42 
 
 		 878 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  26.42 
 
 		 878 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  32.28 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.82 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26.22 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  25.96 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  27.34 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  27.54 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.19 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  28.87 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  28.03 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  27.44 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.97 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.09 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  30.47 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  26.85 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 		 216 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.84 
 
 		 884 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  26.95 
 
 		 240 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  25.67 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 211 aa  52.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  27.85 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.76 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>