More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2413 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  623  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.68 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  39.84 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  36.64 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  41 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4555  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  31.15 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  29.83 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>