More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2306 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  41.96 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  42.67 
 
 		 227 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  35.12 
 
 		 203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.51 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.51 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.51 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.51 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.51 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 211 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 211 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  30.88 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.33 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.05 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.68 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.02 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.4 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.33 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  29.77 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.4 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  26.34 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.69 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  32.64 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  32.64 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.43 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  32.63 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  34.25 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  24.62 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  24.77 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.44 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  27.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.8 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.98 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>