102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2301 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  100 
 
 		 748 aa  1537    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  48.02 
 
 		 761 aa  650    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  36.86 
 
 		 757 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  38.61 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  37.84 
 
 		 758 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  35.45 
 
 		 764 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  37.22 
 
 		 797 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.79 
 
 		 722 aa  362  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.57 
 
 		 641 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  41.39 
 
 		 784 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.25 
 
 		 600 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  34.75 
 
 		 763 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  28.32 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  26.91 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  41.84 
 
 		 466 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.93 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 475 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  25.93 
 
 		 531 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 464 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  45.74 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 443 aa  87.4  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  34.75 
 
 		 432 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 423 aa  86.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  25.06 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  40 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.84 
 
 		 459 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.33 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  36.5 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.8 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  34.33 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  36.18 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  36.43 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  36.26 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  23.41 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  24.91 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.1 
 
 		 595 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 453 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  35.96 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  30.73 
 
 		 599 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  32.23 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  33.12 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  34.35 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.8 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  32.64 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  32.64 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  33.09 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  33.33 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  23.79 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  23.79 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  34.38 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  33.33 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  25.26 
 
 		 585 aa  62  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  31.01 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  26.23 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  28.15 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  30.52 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  27.86 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  30.87 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  36.11 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  38.64 
 
 		 421 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 457 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.35 
 
 		 540 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  25.17 
 
 		 595 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  34.65 
 
 		 465 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  28.85 
 
 		 618 aa  54.3  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  32.08 
 
 		 437 aa  54.3  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 676 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  27.87 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.67 
 
 		 519 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 661 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  22.2 
 
 		 595 aa  49.3  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  24.62 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 460 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  30.81 
 
 		 483 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  30.83 
 
 		 691 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5071  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.98 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  35.48 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  35.48 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 462 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  26.19 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  28.17 
 
 		 547 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.39 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  27.01 
 
 		 660 aa  45.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>