40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2299 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  68.59 
 
 
201 aa  261  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  71.5 
 
 
197 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  71.5 
 
 
197 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  71.5 
 
 
197 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  64.8 
 
 
193 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  53.37 
 
 
210 aa  197  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  52.55 
 
 
210 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  56.84 
 
 
249 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  57.07 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  62.18 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  45.16 
 
 
205 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  42.5 
 
 
224 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  42.46 
 
 
200 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
142 aa  58.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  26.51 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.09 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  30.17 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  25.58 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 
225 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  26.67 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  26.17 
 
 
472 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  28.33 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  42.86 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>