More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2026 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 394 aa  798    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  59.29 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  57.77 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  58.82 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  57.29 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  58.65 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  52.34 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  52.71 
 
 		 398 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  54.86 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  53.78 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  49.88 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  49.75 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  48.34 
 
 		 462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  48.57 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  47.34 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.72 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  38.67 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  40.43 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.43 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.87 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.86 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.17 
 
 		 436 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  37.56 
 
 		 417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.17 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.17 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  37.4 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  36.01 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.06 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.59 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  34.62 
 
 		 437 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  38.21 
 
 		 433 aa  242  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 427 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  40.49 
 
 		 720 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.38 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  38.14 
 
 		 438 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  38.03 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 		 438 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  38.46 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.08 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  36.62 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  38.17 
 
 		 438 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  34.1 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.77 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  37.6 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  37.76 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.51 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  40.22 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  37.22 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  38.86 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  37.67 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  39.67 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  37.17 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.63 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.53 
 
 		 474 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  39.89 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  36.99 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  40.24 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  37.26 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.13 
 
 		 411 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  34.95 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  36.24 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.94 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.55 
 
 		 462 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  34.85 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  35.09 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  39.38 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  35.08 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 418 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  35.77 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  33.86 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  33.68 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  40.16 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.03 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>