134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1973 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  41.87 
 
 
201 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  42.58 
 
 
213 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  41.83 
 
 
213 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  40.28 
 
 
211 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  39.81 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  36.74 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  34.19 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  34.19 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  36.71 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  35.39 
 
 
236 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  39.11 
 
 
207 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  38.1 
 
 
215 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  37.08 
 
 
228 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  34.33 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  34.33 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  38.79 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.79 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  39.9 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  40.82 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.82 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  33.76 
 
 
229 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.21 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  39.46 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  35.24 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.46 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  36.16 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  40.43 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  33.19 
 
 
244 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.77 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.62 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  31.1 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.94 
 
 
254 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  29.74 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.88 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.85 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.11 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.47 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  31.84 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.14 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  30.49 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  30.7 
 
 
997 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  34.74 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  36.5 
 
 
703 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  27.63 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  36.5 
 
 
703 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.53 
 
 
447 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.64 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  26.64 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  29.22 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  34.04 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  24.35 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  34.84 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.82 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.2 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  38.54 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  29.47 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  32.39 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  29.81 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  34.34 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  35.25 
 
 
703 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  34.31 
 
 
708 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  32.74 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  28.48 
 
 
578 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  33.82 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.45 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  27.93 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.22 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  29.58 
 
 
302 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  36.97 
 
 
724 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  28.32 
 
 
645 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.71 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  25.28 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  37.21 
 
 
670 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.99 
 
 
453 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  24.62 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  32.26 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  36.67 
 
 
246 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  26.05 
 
 
652 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  27.97 
 
 
680 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  29.59 
 
 
283 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  30.83 
 
 
279 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  29.63 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  27.8 
 
 
638 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  32.37 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  27.08 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  30.3 
 
 
559 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.65 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  30.22 
 
 
243 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  31.9 
 
 
561 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  29.61 
 
 
449 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  28.97 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5728  PE-PGRS family protein  29.17 
 
 
502 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  29.17 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.37 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  32.33 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  38.24 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.21 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  30.05 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>