More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1948 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  56.78 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  50 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  51.52 
 
 		 242 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  50.64 
 
 		 284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  46.84 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  47.79 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  45.49 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  42.49 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  42.06 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  40.97 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  39.08 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  41.41 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.47 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  39.3 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  38.7 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  37.99 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  39.04 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.77 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  36 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.09 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  39.57 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  38.7 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.12 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  38.77 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  41.89 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.08 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.08 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.08 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  35.96 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  39.66 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  38.22 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  39.47 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  38.1 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  35.68 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  36.25 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  36.25 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  40.69 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.63 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  37.55 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  40.57 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  34.22 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  34.7 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  36.75 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  34.75 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 337 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  36.24 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  34.27 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.22 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  35.27 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  34.27 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.35 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  34.21 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.56 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.51 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>