114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1939 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  52.07 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
135 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
134 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
134 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
136 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  36.29 
 
 
139 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
136 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
136 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  31.34 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  31.34 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  31.34 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.4 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  34.17 
 
 
131 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  38.28 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  31.3 
 
 
135 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  33.87 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.16 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  23.21 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  22.69 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
163 aa  53.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  31.67 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.6 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  24.41 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.8 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  24 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  23.89 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  25.83 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  27.64 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  21.74 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  21.24 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  22.41 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  25.83 
 
 
168 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  24.19 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>