124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1926 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  100 
 
 
459 aa  931    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  53.28 
 
 
426 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  60.22 
 
 
421 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  48.39 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  57.81 
 
 
347 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  56.1 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  46.08 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  43.14 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  43.02 
 
 
224 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  38.05 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  40 
 
 
203 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  38.79 
 
 
187 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  38.79 
 
 
225 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  39.13 
 
 
190 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  39.13 
 
 
190 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  37.72 
 
 
186 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  34.27 
 
 
234 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 
625 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  39.13 
 
 
184 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  41.77 
 
 
182 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  40.54 
 
 
194 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  35 
 
 
182 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  34.78 
 
 
186 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  41.94 
 
 
124 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  34.17 
 
 
183 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  34.17 
 
 
182 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  34.17 
 
 
182 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  34.17 
 
 
182 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  34.17 
 
 
182 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  34.17 
 
 
182 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  36.61 
 
 
183 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  35.88 
 
 
182 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  33.33 
 
 
659 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  39.8 
 
 
124 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  31.71 
 
 
497 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  34.59 
 
 
637 aa  57  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  34.82 
 
 
186 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  44.07 
 
 
143 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  32.76 
 
 
186 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  34.59 
 
 
659 aa  56.6  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  35.14 
 
 
183 aa  56.6  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  30.06 
 
 
636 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  41.77 
 
 
195 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  31.85 
 
 
182 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  34 
 
 
129 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  31.03 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  36 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  34.48 
 
 
540 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  44.16 
 
 
178 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  32 
 
 
452 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  42.68 
 
 
229 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  38.78 
 
 
124 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  31.47 
 
 
526 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  38.14 
 
 
205 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  33.01 
 
 
341 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  41.77 
 
 
169 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  37.76 
 
 
124 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  32.62 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  47.89 
 
 
180 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  37.04 
 
 
236 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  43.04 
 
 
182 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  42.86 
 
 
179 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  31.2 
 
 
597 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  31.2 
 
 
598 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  39.39 
 
 
513 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  30.7 
 
 
187 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  34.59 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  30.07 
 
 
544 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  29.31 
 
 
189 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  31.36 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  44.16 
 
 
185 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  36.54 
 
 
179 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  32.97 
 
 
182 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  32.97 
 
 
182 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  32.62 
 
 
589 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  43.04 
 
 
183 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  31.03 
 
 
608 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  41.77 
 
 
182 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  31.67 
 
 
182 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  30.83 
 
 
182 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  29.31 
 
 
190 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  40.51 
 
 
163 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  30.7 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  35.34 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  31.67 
 
 
182 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>