More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1916 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  73.72 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  73.72 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  80.19 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  75.86 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  73.39 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  75 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  74.04 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  74.04 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  72.22 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  73.15 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  59.03 
 
 		 136 aa  160  8.000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  66.04 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  66.98 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  62.86 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  59.68 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  55.97 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  53.12 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  62.26 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  60.38 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  58.49 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  59.43 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  59.43 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  53.04 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  57.55 
 
 		 168 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  54.63 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  52.68 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  52.68 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  52.14 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  51.4 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 160 aa  120  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  46.2 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  40 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  38.84 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  38.84 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  38.02 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  39.02 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  41.35 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  38.02 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  38.02 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  38.33 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  36.22 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  37.1 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  37.82 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  39.64 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  37.84 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  37.39 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  37.04 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  36.52 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  37.25 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  38.32 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  35.45 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.29 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  32.77 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  35.64 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  35.45 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  35.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>