149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1898 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 416 aa  843    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  46.4 
 
 		 412 aa  315  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  46.65 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  40.21 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  39.16 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  38.63 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  37.41 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  37.29 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  37.66 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  36.82 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  38.32 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  33.24 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  32.29 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  33.97 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.83 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  31.42 
 
 		 421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32.62 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.57 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.45 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  29.48 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  31.78 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  31.91 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  31.78 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  31.75 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  31.39 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  31.94 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.78 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.78 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.78 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  30.7 
 
 		 407 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  32.51 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  28.57 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.38 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  31.83 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  28.37 
 
 		 524 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  31.78 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  29.4 
 
 		 413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  29.13 
 
 		 413 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  29.4 
 
 		 413 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  26.63 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  29.49 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  28.21 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  27.01 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  30.42 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.92 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  29.44 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  29.16 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  28.1 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  30.85 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  28.23 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.4 
 
 		 436 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  27.51 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  28.28 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  29.44 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.37 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  29.12 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.46 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  27.79 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  30 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  22.92 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  29.02 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  27.9 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.25 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  27.9 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  22.97 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  26.79 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  22.49 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  22.49 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  26.75 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  28.23 
 
 		 437 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  25.77 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27.2 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25.69 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.28 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  21.17 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.18 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.28 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  26.29 
 
 		 264 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  22.82 
 
 		 389 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  22.82 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.76 
 
 		 833 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.76 
 
 		 833 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  32.24 
 
 		 225 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.76 
 
 		 859 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  24.38 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  26.72 
 
 		 542 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  25.48 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.65 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.65 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  22.32 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  29.05 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.27 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>