More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1832 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  100 
 
 
606 aa  1216    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.24 
 
 
599 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  50.63 
 
 
712 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.67 
 
 
629 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.07 
 
 
749 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.28 
 
 
617 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.15 
 
 
619 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
619 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.54 
 
 
613 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.15 
 
 
612 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.45 
 
 
611 aa  495  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  46.71 
 
 
612 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  46.6 
 
 
615 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  47.38 
 
 
539 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  46.48 
 
 
611 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  48.41 
 
 
593 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.76 
 
 
633 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  46.18 
 
 
611 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 
637 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
611 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
633 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  49.38 
 
 
568 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.94 
 
 
611 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.33 
 
 
609 aa  485  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
611 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.4 
 
 
612 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
623 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
623 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 
623 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  46.66 
 
 
597 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 
623 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  48.99 
 
 
533 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.4 
 
 
612 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
629 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 
623 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
623 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  45.41 
 
 
611 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
623 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
623 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.42 
 
 
626 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.6 
 
 
611 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.96 
 
 
629 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  45.94 
 
 
625 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.64 
 
 
599 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
623 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
611 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 
623 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
623 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
540 aa  475  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  47.62 
 
 
613 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  46.3 
 
 
624 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  46.3 
 
 
640 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.35 
 
 
630 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  48.92 
 
 
543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  46.11 
 
 
588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  48.93 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  48.82 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  47.26 
 
 
562 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 
623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.27 
 
 
531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.34 
 
 
606 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  47.01 
 
 
530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.27 
 
 
610 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  47.39 
 
 
547 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  44.44 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.89 
 
 
586 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.71 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 
632 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  48.56 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  46.36 
 
 
546 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  46.59 
 
 
609 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  46.27 
 
 
543 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
541 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.93 
 
 
549 aa  465  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
601 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 
615 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
573 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.8 
 
 
596 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.23 
 
 
633 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  47.62 
 
 
533 aa  465  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.03 
 
 
619 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  46.7 
 
 
593 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 
676 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.37 
 
 
633 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  48.08 
 
 
533 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.01 
 
 
555 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  43.43 
 
 
619 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.45 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 
627 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
550 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  45.47 
 
 
530 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  48.14 
 
 
566 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
536 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 
543 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  46.53 
 
 
624 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  46.91 
 
 
573 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
609 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  46.49 
 
 
555 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>