More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1829 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 243 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  37.91 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  32.93 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.89 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>