More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1749 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  100 
 
 
376 aa  754    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  66.57 
 
 
384 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  65.98 
 
 
382 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  64.15 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  63.89 
 
 
383 aa  424  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  65.52 
 
 
362 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  59.44 
 
 
360 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  57.31 
 
 
362 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  44.44 
 
 
383 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  46.01 
 
 
399 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  42.75 
 
 
385 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  44.91 
 
 
385 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  43.24 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  44.71 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  44.09 
 
 
389 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  42.86 
 
 
394 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  44.84 
 
 
382 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  44.47 
 
 
390 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  43.77 
 
 
393 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  44.06 
 
 
393 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  41.19 
 
 
382 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.77 
 
 
405 aa  252  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  42.49 
 
 
394 aa  249  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.67 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40.72 
 
 
407 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  40.33 
 
 
389 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  40.06 
 
 
387 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  40.41 
 
 
379 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  39.84 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.85 
 
 
393 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.16 
 
 
389 aa  235  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  40.29 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.22 
 
 
386 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.23 
 
 
367 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  38.89 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  34.95 
 
 
395 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.79 
 
 
447 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  35.05 
 
 
403 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.75 
 
 
387 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  42.33 
 
 
388 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  39.64 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.01 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  34.96 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.06 
 
 
477 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  38.32 
 
 
394 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  36.99 
 
 
475 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  36.74 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  37.68 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.99 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  37.68 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.75 
 
 
457 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  36.26 
 
 
445 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.38 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.38 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.38 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  36.16 
 
 
380 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.9 
 
 
418 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.13 
 
 
386 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  37.47 
 
 
414 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  34.38 
 
 
405 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  34.38 
 
 
393 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.26 
 
 
395 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.41 
 
 
359 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34.49 
 
 
386 aa  207  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  34.38 
 
 
393 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  34.89 
 
 
393 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  36.75 
 
 
394 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.36 
 
 
413 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  40.47 
 
 
378 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  34.53 
 
 
381 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  35.75 
 
 
454 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  35.75 
 
 
449 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  35.75 
 
 
437 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.01 
 
 
407 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  35.75 
 
 
442 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.34 
 
 
399 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.65 
 
 
433 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  35.75 
 
 
437 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  35.75 
 
 
437 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.24 
 
 
400 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  36.24 
 
 
498 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  35.47 
 
 
454 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  39.77 
 
 
359 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.6 
 
 
381 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  37.08 
 
 
420 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.06 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  34.19 
 
 
503 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  34.3 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  35.14 
 
 
466 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  36.29 
 
 
406 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  33.6 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  35.26 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.3 
 
 
447 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.62 
 
 
389 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  35.9 
 
 
378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  40.48 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.5 
 
 
401 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.7 
 
 
361 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  34.07 
 
 
389 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.43 
 
 
451 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>