More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1663 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  353  7.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  82.49 
 
 		 177 aa  299  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  81.92 
 
 		 177 aa  295  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  81.92 
 
 		 177 aa  295  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  80.79 
 
 		 177 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  80.79 
 
 		 177 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  78.53 
 
 		 177 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  277  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 		 177 aa  261  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  260  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  254  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  71.19 
 
 		 177 aa  253  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  71.75 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  67.8 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  69.49 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  68.93 
 
 		 177 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  68.93 
 
 		 177 aa  245  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  68.36 
 
 		 177 aa  240  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  235  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  217  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  59.89 
 
 		 177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  55.43 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  56 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  56.82 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 177 aa  190  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.14 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  50.28 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3509  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000396017  hitchhiker  0.00000010719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.46 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>