More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1651 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1651  protease Do  100 
 
 
492 aa  972    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  58.21 
 
 
474 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  58.21 
 
 
474 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  55.15 
 
 
476 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  56.65 
 
 
468 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  55.76 
 
 
467 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  57.24 
 
 
465 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  55.68 
 
 
467 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  55.15 
 
 
463 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  54.67 
 
 
464 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  54.71 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  54.14 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  53.67 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  53.41 
 
 
464 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  53.06 
 
 
464 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  54.29 
 
 
496 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  51.66 
 
 
467 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  49.45 
 
 
480 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  50.22 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  48.98 
 
 
476 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  49.13 
 
 
494 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  50.34 
 
 
488 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  50.34 
 
 
488 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  48.11 
 
 
461 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  50.46 
 
 
471 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  50 
 
 
471 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  48.11 
 
 
461 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  46.49 
 
 
504 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  47.86 
 
 
461 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  49.89 
 
 
485 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  49.12 
 
 
491 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  42.89 
 
 
465 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  46.26 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.55 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.69 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.03 
 
 
465 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  43.19 
 
 
473 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.19 
 
 
460 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  44.12 
 
 
458 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  39.26 
 
 
503 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  40.95 
 
 
459 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.47 
 
 
513 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.18 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  40.18 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.19 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.19 
 
 
458 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  41.91 
 
 
469 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  39.59 
 
 
476 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40.57 
 
 
478 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.88 
 
 
385 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.37 
 
 
483 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41 
 
 
508 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41 
 
 
489 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.13 
 
 
483 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.98 
 
 
501 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.7 
 
 
472 aa  276  5e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.08 
 
 
412 aa  276  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  43.02 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.09 
 
 
464 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.5 
 
 
456 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.07 
 
 
479 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.82 
 
 
464 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  40.58 
 
 
493 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  40.58 
 
 
506 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.2 
 
 
514 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  41.18 
 
 
481 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.85 
 
 
456 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  41.65 
 
 
457 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.12 
 
 
466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.39 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.09 
 
 
511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.2 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.05 
 
 
474 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.23 
 
 
493 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.55 
 
 
398 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.81 
 
 
474 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  41.18 
 
 
481 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.29 
 
 
492 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.63 
 
 
485 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  38.55 
 
 
462 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  35.84 
 
 
461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.6 
 
 
476 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  38 
 
 
478 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  38 
 
 
478 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  47.38 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  39.13 
 
 
500 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  38 
 
 
475 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  38 
 
 
475 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  38 
 
 
475 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.72 
 
 
474 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.98 
 
 
496 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  35.78 
 
 
474 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  35.78 
 
 
474 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.14 
 
 
479 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.48 
 
 
491 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  35.78 
 
 
474 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  35.78 
 
 
474 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  42.58 
 
 
477 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  35.78 
 
 
474 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.22 
 
 
446 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>